公司进出口退税流程涉及多个步骤，以下是一个大致的流程：
办理进出口货物退（免）税认定：出口企业在办理《对外贸易经营者备案登记表》后30日内，或者未取得进出口经营权的生产企业代理出口在发生首笔出口业务之日起30日内，必须到所在地主管退税的税务机关办理出口货物退（免）税认定手续，纳入进出口退税管理。
使用进出口退税申报软件：进出口企业在退（免）税申报时必须使用国税局进出口退税申报软件。
确认进出口销售收入：出口企业应在货物实际报关出口，取得提单并向银行办妥交单手续时，确认销售收入的实现。生产企业应在当期的增值税纳税申报表上反映免抵退出口收入。
准备相关单证：企业需要准备相关的单证，如出口商品专用发票、出口货物报关单、外汇核销单等。
数据录入与申报：企业需要在退税申报系统中录入相关数据，并在规定的申报期限内（通常为每月15日前）进行退税申报。
税务机关审核：税务机关会对企业的退税申报进行审核，确认申报数据的真实性和准确性。
退税款发放：审核通过后，税务机关会按照规定的程序将退税款发放给企业。
