申请食品流通许可证备案时，通常需要准备以下材料：
《食品流通许可申请书》：这是申请的基本表格，需要填写完整并加盖公章。
《名称预先核准通知书》或营业执照复印件（查验原件）：如果已经取得了《名称预先核准通知书》或者营业执照，需要提供复印件以供查验。
经营场所合法使用的有关证明：包括房屋所有权证、租赁协议等证明文件，证明经营场所的合法使用权。
负责人的身份证明：需要提供负责人的身份证或其他有效身份证明文件的复印件。
委托书以及委托代理人或者指定代表的身份证明（如适用）：如果申请人是委托代理人或指定代表进行申请，需要提供委托书以及相应的身份证明。
食品安全管理制度：需要提供与食品经营相关的食品安全管理制度文本，包括食品采购、储存、销售、运输等环节的管理规定。
与其经营活动相适应的食品经营设备清单：需要列出与食品经营相关的设备、工具清单，以证明具备与经营活动相适应的设备条件。
食品从业人员健康证和卫生法规培训证复印件：需要提供食品从业人员的健康证和卫生法规培训证复印件，以证明从业人员具备相应的健康条件和卫生法规知识。
申请乳制品项目的经营者，还应提交开户行证明和书面声明等：如果申请的是乳制品项目，需要提供开户行证明和书面声明等相关材料。
专职或者兼职食品安全管理人员的身份证明（初中以上学历证明和培训合格证明）：需要提供食品安全管理人员的身份证明、学历证明和培训合格证明等相关材料。
经营场所使用证明（如房屋所有权证或租赁协议等）及经营场所的具体方位图：需要提供经营场所的具体地址和位置图，以便相关部门进行核查。
与食品经营相关的经营设施空间平面布局图、操作流程等文件（标明用途、面积、尺寸、比例、人流物流、设备设施位置等）：需要提供与食品经营相关的设施布局图和操作流程图等相关文件，以证明经营场所的设施布局和操作流程符合相关要求。